Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBL1P28749 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms