Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NFKBIAP25963 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms