Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDHBP21912 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDHBP21912 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHBP21912 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHBP21912 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHBP21912 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHBP21912 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHBP21912 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHBP21912 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHBP21912 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDHBP21912 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms