Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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