Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms