Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NME1P15531 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME1P15531 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME1P15531 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms