Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSF2RAP15509 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2RAP15509 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms