Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF1P10914 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF1P10914 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF1P10914 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF1P10914 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF1P10914 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF1P10914 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF1P10914 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF1P10914 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF1P10914 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF1P10914 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF1P10914 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF1P10914 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF1P10914 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms