Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C4BP0C0L5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C4BP0C0L5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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