Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP1P09455 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP1P09455 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP1P09455 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBP1P09455 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBP1P09455 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP1P09455 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms