Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB5P09067 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HOXB5P09067 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms