Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HLA-DQB1P01920 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HLA-DQB1P01920 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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