Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SKAP2O75563 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SKAP2O75563 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms