Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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