Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGSM2O43147 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGSM2O43147 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms