Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF10AO00220 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TNFRSF10AO00220 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms