Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HHLA1C9JL84 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms