Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMGB1P1B2RPK0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms