Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms