Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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