Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SNX13Q9Y5W8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SNX13Q9Y5W8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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SNX13Q9Y5W8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SNX13Q9Y5W8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SNX13Q9Y5W8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SNX13Q9Y5W8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX13Q9Y5W8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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