Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAPPC8Q9Y2L5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC8Q9Y2L5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms