Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SNX7Q9UNH6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms