Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMKLBQ9ULI2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms