Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTNNA3Q9UI47 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms