Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
XCL2Q9UBD3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms