Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LRP2BPQ9P2M1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms