Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PFDN4Q9NQP4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PFDN4Q9NQP4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PFDN4Q9NQP4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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