Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPERQ9BY12 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPERQ9BY12 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms