Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYCP2Q9BX26 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms