Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SSBP4Q9BWG4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms