Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms