Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEMA3CQ99985 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms