Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBBP8Q99708 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms