Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
LINC00208Q96KT6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms