Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms