Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00526Q96FQ7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00526Q96FQ7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms