Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SGF29Q96ES7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGF29Q96ES7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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