Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC10Q969S8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC10Q969S8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms