Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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TTC9Q92623 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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TTC9Q92623 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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TTC9Q92623 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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TTC9Q92623 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TTC9Q92623 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TTC9Q92623 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TTC9Q92623 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TTC9Q92623 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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