Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMPDL3AQ92484 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms