Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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RNF148Q8N7C7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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