Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ZNF549Q6P9A3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ZNF549Q6P9A3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ZNF549Q6P9A3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF549Q6P9A3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF549Q6P9A3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF549Q6P9A3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF549Q6P9A3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF549Q6P9A3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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