Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRNP1Q6NT89 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms