Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATL3Q6DD88 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms