Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD40Q6AI12 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms