Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PXDC1Q5TGL8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms