Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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