Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms