Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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